After doing these courses, I feel confident creating professional visualizations and dashboards
Shoebur RahmanProcurement Specialist, Giz Bangladesh
코스 설명
ChIP-seq 분석은 생물정보학의 중요한 분야예요. 이 분석을 통해 우리 몸의 세포가 어떻게 기능하는지 들여다볼 수 있습니다. 지금 이 웹페이지를 읽도록 돕는 뇌세포든, 질병을 일으킬 수 있는 미생물을 찾아다니는 면역세포든, 모두 같은 유전체를 가지고 있어요. 이들을 구분하는 것은 바로 그때그때 활성화된 유전자입니다. 어떤 유전자가 켜지고 꺼지는지는 유전자를 활성화하거나 비활성화할 수 있는 단백질들의 복잡한 조절 체계에 의해 결정돼요. 이 조절 장치가 균형을 잃으면 암 등 심각한 질병으로 이어질 수 있습니다. ChIP-seq 분석은 이러한 조절 단백질의 기능과 질병에 어떻게 기여하는지를 이해하게 해주며, 세포가 통제를 벗어나지 않도록 개입할 수 있는 실마리도 제공합니다. 이 강의에서는 실제 데이터셋을 다루며, R에서 ChIP-seq 데이터를 처리하고 분석하는 방법을 배워 보겠습니다.
사전 요구 사항
커리큘럼
코스 개요
1
ChIP-seq 소개
ChIP-seq 실험 소개입니다. 왜 흥미로울까요? ChIP-seq으로 어떤 현상을 연구할 수 있고, 이러한 실험에서 무엇을 배울 수 있는지 알아봅니다.
2
기초로 돌아가기 - ChIP-seq 데이터 준비
이제 본격적으로 ChIP-seq 분석을 시작합니다. 이 장에서는 데이터를 가져오고 정제하는 Bioconductor 도구를 소개합니다.
3
ChIP-seq 샘플 비교하기
이 장에서는 ChIP-seq 샘플 간의 차이를 식별하고 시각화하는 기법을 소개합니다.
4
피크에서 유전자, 그리고 기능으로
샘플 집단 간 결합의 차이를 파악하는 것은 중요하지만, 그 의미는 무엇일까요? 이 장에서는 차등 결합 결과를 해석하여 피크 호출에서 생물학적으로 의미 있는 통찰로 이어지는 전략을 다룹니다.
R
R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq
코스
완료
