ChIP-seq avec Bioconductor en R

IntermédiaireNiveau de compétence

Actualisé 09/2024

Apprenez à analyser et à interpréter les données ChIP-seq à l'aide de Bioconductor en utilisant un ensemble de données sur le cancer humain.

Description du cours

L’analyse ChIP-seq est une branche importante de la bioinformatique. Elle nous ouvre une fenêtre sur la machinerie qui fait fonctionner les cellules de notre corps. Qu’il s’agisse d’un neurone qui vous aide à lire cette page web ou d’une cellule immunitaire qui patrouille à la recherche de micro-organismes pouvant vous rendre malade, toutes portent le même génome. Ce qui les différencie, ce sont les gènes actifs à un moment donné. Les gènes concernés sont déterminés par un système complexe de protéines capables d’activer ou de désactiver les gènes. Lorsque cette machinerie de régulation se dérègle, elle peut conduire à des cancers et à d’autres maladies invalidantes. L’analyse ChIP-seq nous permet de comprendre la fonction des protéines régulatrices, leur contribution potentielle aux maladies et offre des pistes pour intervenir afin d’éviter que les cellules ne perdent le contrôle. Dans ce cours, vous explorerez un jeu de données réel tout en apprenant à traiter et analyser des données ChIP-seq en R.

Prérequis

Intermediate R Introduction to Bioconductor in R

Introduction to ChIP-seq

Introduction to ChIP-seq experiments. Why are they interesting? What sort of phenomena can be studied with ChIP-seq and what can we learn from these experiments.

What is ChIP-seq?

Description du cours

Obtenez un certificat de réussite

Rejoignez plus de .css-nklxlk{color:var(--wf-brand--main, #03EF62);}19 millions d'utilisateurs et commencez ChIP-seq avec Bioconductor en R dès aujourd'hui !

Créez votre compte gratuitement

Apprenez où que vous soyez avec l'application DataCamp

Rejoignez plus de 19 millions d'utilisateurs et commencez ChIP-seq avec Bioconductor en R dès aujourd'hui !