ChIP-seq con Bioconductor in R

L’analisi ChIP-seq è un ramo fondamentale della bioinformatica. Ci offre uno sguardo dentro la macchina che fa funzionare le cellule del nostro corpo. Che si tratti di un neurone che ti aiuta a leggere questa pagina web o di una cellula immunitaria che pattuglia il corpo alla ricerca di microrganismi che potrebbero farti ammalare, tutte portano lo stesso genoma. Ciò che le distingue sono i geni attivi in un dato momento. Quali geni si attivano è determinato da un complesso sistema di proteine che possono accendere e spegnere i geni. Quando questa macchina di regolazione finisce fuori controllo, può portare a tumori e ad altre malattie debilitanti. L’analisi ChIP-seq ci permette di capire la funzione delle proteine regolatorie, come possano contribuire alla malattia e fornisce spunti su come potremmo intervenire per evitare che le cellule vadano fuori controllo. In questo corso esplorerai un insieme di dati reale mentre impari a processare e analizzare dati ChIP-seq in R.