ChIP-seq con Bioconductor in R

IntermedioLivello di competenza

Aggiornato 09/2024

Impara come analizzare e interpretare i dati ChIP-seq con l'aiuto di Bioconductor usando un set di dati sul cancro umano.

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Descrizione del corso

L’analisi ChIP-seq è un ramo fondamentale della bioinformatica. Ci offre uno sguardo dentro la macchina che fa funzionare le cellule del nostro corpo. Che si tratti di un neurone che ti aiuta a leggere questa pagina web o di una cellula immunitaria che pattuglia il corpo alla ricerca di microrganismi che potrebbero farti ammalare, tutte portano lo stesso genoma. Ciò che le distingue sono i geni attivi in un dato momento. Quali geni si attivano è determinato da un complesso sistema di proteine che possono accendere e spegnere i geni. Quando questa macchina di regolazione finisce fuori controllo, può portare a tumori e ad altre malattie debilitanti. L’analisi ChIP-seq ci permette di capire la funzione delle proteine regolatorie, come possano contribuire alla malattia e fornisce spunti su come potremmo intervenire per evitare che le cellule vadano fuori controllo. In questo corso esplorerai un insieme di dati reale mentre impari a processare e analizzare dati ChIP-seq in R.

Prerequisiti

Intermediate R Introduction to Bioconductor in R

Introduction to ChIP-seq

Introduction to ChIP-seq experiments. Why are they interesting? What sort of phenomena can be studied with ChIP-seq and what can we learn from these experiments.

What is ChIP-seq?

Descrizione del corso

Ottieni Attestato di conseguimento

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