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Curso

ChIP-seq con Bioconductor en R

Intermedio4 h

Aprende a analizar e interpretar datos ChIP-seq con la ayuda de Bioconductor utilizando un conjunto de datos sobre cáncer humano.

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Descripción del curso

El análisis de ChIP-seq es una rama importante de la bioinformática. Nos ofrece una ventana a la maquinaria que hace funcionar las células de nuestro cuerpo. Ya sea una neurona que te ayuda a leer esta página web o una célula inmunitaria patrullando tu cuerpo en busca de microorganismos que podrían enfermarte, todas comparten el mismo genoma. Lo que las diferencia son los genes que están activos en cada momento. Qué genes se activan lo determina un complejo sistema de proteínas que pueden activar y desactivar genes. Cuando esta maquinaria reguladora se descontrola, puede dar lugar a cáncer y otras enfermedades debilitantes. El análisis de ChIP-seq nos permite entender la función de las proteínas reguladoras, cómo pueden contribuir a la enfermedad y ofrece pistas sobre cómo podríamos intervenir para evitar que las células se desregulen. En este curso, explorarás un conjunto de datos real mientras aprendes a procesar y analizar datos de ChIP-seq en R.

Requisitos previos

Programa de formación

Contenido del curso

1

Introducción a ChIP-seq

4

De picos a genes y a función

Identificar la unión diferencial entre grupos de muestras está muy bien, pero ¿qué significa? Este capítulo trata estrategias para interpretar los resultados de unión diferencial y pasar de llamadas de picos a conclusiones con sentido biológico.
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ChIP-seq con Bioconductor en R

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