การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

เทคโนโลยีจีโนมิกส์เชิงฟังก์ชัน เช่น microarray, การจัดลำดับนิวคลีโอไทด์ และแมสสเปกโตรเมทรี ช่วยให้นักวิทยาศาสตร์สามารถวัดระดับการแสดงออกของยีนในระดับจีโนมได้อย่างครอบคลุมและปราศจากอคติ ไม่ว่าจะสร้างข้อมูลเองหรือต้องการสำรวจชุดข้อมูลสาธารณะที่มีอยู่มากมาย สิ่งแรกที่ต้องทำคือเรียนรู้วิธีวิเคราะห์การทดลองประเภทนี้ ในคอร์สนี้ จะได้เรียนรู้วิธีใช้แพ็กเกจ R/Bioconductor ที่ชื่อว่า limma เพื่อทำการวิเคราะห์ differential expression บนรูปแบบการทดลองที่พบได้บ่อยที่สุด นอกจากนี้ยังจะได้เรียนรู้การเตรียมข้อมูลล่วงหน้า การระบุและแก้ไข batch effect การประเมินผลลัพธ์ด้วยการแสดงภาพ และการทดสอบ enrichment หลังจากเรียนจบคอร์สนี้แล้ว จะมีกลยุทธ์การวิเคราะห์ทั่วไปสำหรับดึงข้อมูลเชิงลึกจากการศึกษาจีโนมิกส์เชิงฟังก์ชันได้ทุกรูปแบบ