R での limma を用いた Differential Expression 解析

マイクロアレイ、シーケンス、質量分析のような機能ゲノミクス技術により、研究者はゲノム全体で遺伝子発現量を偏りなく測定できます。自分でデータを生成する場合でも、公開データセットを活用する場合でも、まずはこの種の実験データの解析方法を学ぶ必要があります。本コースでは、汎用性の高い R/Bioconductor パッケージである limma を使って、最も一般的な実験デザインに対する Differential Expression 解析を実行する方法を学びます。さらに、データの前処理、バッチ効果の特定と補正、結果の可視化、エンリッチメント検定の実施方法も習得します。コース修了後には、あらゆる機能ゲノミクス研究から洞察を得るための一般的な解析戦略が身につきます。