R में Bioconductor के साथ RNA-Seq

RNA-Seq अगली पीढ़ी की एक रोमांचक सीक्वेंसिंग विधि है, जिसका उपयोग किसी विशेष बीमारी या स्थिति के पीछे छिपे जीन और पाथवे की पहचान करने के लिए किया जाता है। जैसे-जैसे हाई-थ्रूपुट सीक्वेंसिंग किफायती और अधिक शोधकर्ताओं के लिए सुलभ होती जा रही है, इस डेटा का विश्लेषण करने का ज्ञान एक अत्यंत मूल्यवान कौशल बनता जा रहा है। हमारे साथ RNA-Seq वर्कफ़्लो सीखिए और यह खोजिए कि आपकी रुचि की स्थिति के लिए कौन से जीन और बायोलॉजिकल प्रोसेस महत्वपूर्ण हो सकते हैं! हम कोर्स की शुरुआत RNA-Seq वर्कफ़्लो के संक्षिप्त परिचय से करेंगे, जिसमें डिफरेंशियल एक्सप्रेशन (DE) विश्लेषण पर जोर होगा। प्रत्येक जीन के काउंट्स से शुरू करते हुए, कोर्स में DE विश्लेषण के लिए डेटा तैयार करना, काउंट डेटा की क्वालिटी जाँचना, आउट्लायर्स की पहचान करना, और डेटा में वैरिएशन के प्रमुख स्रोतों का पता लगाना शामिल होगा। DESeq2 R पैकेज का उपयोग नेगेटिव बाइनॉमियल मॉडल के साथ काउंट डेटा को मॉडल करने और डिफरेंशियली एक्सप्रेस्ड जीन का परीक्षण करने के लिए किया जाएगा। परिणामों का विज़ुअलाइज़ेशन हीटमैप्स और वोल्कैनो प्लॉट्स से किया जाएगा, और महत्वपूर्ण डिफरेंशियली एक्सप्रेस्ड जीन की पहचान कर उन्हें सेव किया जाएगा.