コース説明

RNA-Seq は、特定の疾患や状態に関わる遺伝子や経路を同定するために用いられる、次世代シーケンシングの手法です。ハイスループットシーケンシングのコストが下がり、より多くの研究者がアクセスできるようになった今、このデータを解析するスキルはますます重要になっています。RNA-Seq のワークフローを学び、関心のある状態に関わる遺伝子や生物学的プロセスを特定する方法を習得しましょう。本コースはまず RNA-Seq ワークフローの概要から始まり、特に発現差異（DE）解析に重点を置きます。各遺伝子のカウントデータをもとに、DE 解析のためのデータ準備、カウントデータの品質評価、外れ値の特定、データの主要な変動要因の検出について学びます。DESeq2 R パッケージを使用して負の二項モデルでカウントデータをモデル化し、発現差異のある遺伝子を検定します。結果のヒートマップおよびボルカノプロットによる可視化を行い、有意な発現差異遺伝子を特定して保存します。

前提条件

Introduction to Bioconductor in R Introduction to Data Visualization with ggplot2

RNA-Seq の理論とワークフロー入門

この章では、RNA-Seq データで何ができるかを探り、その魅力について学びます。また、RNA-Seq ワークフローに含まれるさまざまなステップと考慮事項についても理解を深めます。

コース説明

修了証明書を取得

.css-nklxlk{color:var(--wf-brand--main, #03EF62);}19百万人を超える学習者と共にRNA-Seq with Bioconductor in Rを始めましょう！

無料アカウントを作成

DataCamp for Mobileでデータスキルを磨きましょう

19百万人を超える学習者と共にRNA-Seq with Bioconductor in Rを始めましょう！