Build your ultimate AI agent
课程介绍
ChIP-seq 分析是生物信息学中的重要分支。它让我们得以窥见驱动人体细胞运作的精密机制。无论是帮助您阅读此网页的脑细胞，还是在体内巡逻、搜寻致病微生物的免疫细胞，它们都携带相同的基因组。真正的差异在于在特定时间处于活跃状态的基因。哪些基因被激活由一套复杂的蛋白质系统决定，这些蛋白质可以开启或关闭基因。当这种调控机制失控时，可能会导致癌症等严重疾病。ChIP-seq 分析帮助我们理解调控蛋白的功能、它们如何促成疾病，并为如何干预以防止细胞失控提供思路。在本课程中，您将通过一个真实数据集，学习如何在 R 中处理和分析 ChIP-seq 数据。
先修要求
课程大纲
课程大纲
1
ChIP-seq 入门
介绍 ChIP-seq 实验。为什么它有意义？利用 ChIP-seq 能研究哪些现象？我们能从这些实验中学到什么。
2
回归基础——准备 ChIP-seq 数据
现在正式开始 ChIP-seq 分析。本章将介绍用于导入和清洗数据的 Bioconductor 工具。
3
比较 ChIP-seq 样本
本章介绍识别并可视化 ChIP-seq 样本间差异的技术。
4
从峰到基因再到功能
能够识别样本组间的差异结合固然重要，但这意味着什么？本章讨论如何解读差异结合结果，从峰值调用走向具有生物学意义的见解。
R
在 R 中使用 Bioconductor 进行 ChIP-seq 分析
课程完成
