After doing these courses, I feel confident creating professional visualizations and dashboards
Shoebur RahmanProcurement Specialist, Giz Bangladesh
รายละเอียดคอร์ส
การวิเคราะห์ ChIP-seq เป็นสาขาสำคัญของชีวสารสนเทศศาสตร์ ที่เปิดมุมมองให้เราเข้าใจกลไกการทำงานของเซลล์ในร่างกาย ไม่ว่าจะเป็นเซลล์สมองที่ช่วยให้อ่านหน้าเว็บนี้ได้ หรือเซลล์ภูมิคุ้มกันที่คอยป้องกันร่างกายจากเชื้อโรค เซลล์ทั้งหมดล้วนมีจีโนมเหมือนกัน สิ่งที่ทำให้เซลล์แต่ละประเภทแตกต่างกันคือยีนที่ถูกเปิดใช้งานในแต่ละช่วงเวลา ซึ่งควบคุมโดยระบบโปรตีนที่ซับซ้อน ทำหน้าที่เปิดและปิดการทำงานของยีน เมื่อกลไกการควบคุมนี้ผิดปกติ อาจนำไปสู่มะเร็งและโรคร้ายแรงอื่น ๆ การวิเคราะห์ ChIP-seq ช่วยให้เข้าใจหน้าที่ของโปรตีนที่ทำหน้าที่ควบคุม บทบาทของโปรตีนเหล่านี้ต่อการเกิดโรค และแนวทางที่อาจใช้แทรกแซงเพื่อป้องกันไม่ให้เซลล์เสียการควบคุม ในคอร์สนี้ จะได้สำรวจชุดข้อมูลจริง พร้อมเรียนรู้วิธีประมวลผลและวิเคราะห์ข้อมูล ChIP-seq ใน R
ข้อกำหนดเบื้องต้น
หลักสูตร
โครงสร้างคอร์ส
1
ChIP-seq เบื้องต้น
แนะนำการทดลอง ChIP-seq ว่ามีความน่าสนใจอย่างไร สามารถศึกษาปรากฏการณ์ใดได้บ้าง และเราสามารถเรียนรู้อะไรจากการทดลองเหล่านี้
2
กลับสู่พื้นฐาน — การเตรียมข้อมูล ChIP-seq
เริ่มต้นการวิเคราะห์ ChIP-seq อย่างจริงจัง บทนี้แนะนำเครื่องมือใน Bioconductor สำหรับนำเข้าและทำความสะอาดข้อมูล
3
การเปรียบเทียบตัวอย่าง ChIP-seq
บทนี้แนะนำเทคนิคในการระบุและแสดงภาพความแตกต่างระหว่างตัวอย่าง ChIP-seq
4
จากพีคสู่ยีนและความหมายทางชีววิทยา
การระบุความแตกต่างของการจับระหว่างกลุ่มตัวอย่างเป็นสิ่งที่มีประโยชน์มาก แต่ผลลัพธ์เหล่านั้นหมายความว่าอะไร บทนี้กล่าวถึงกลยุทธ์ในการตีความผลการจับที่แตกต่างกัน เพื่อนำข้อมูลจากพีคไปสู่ข้อมูลเชิงลึกที่มีความหมายทางชีววิทยา
R
ChIP-seq with Bioconductor in R
เรียนจบแล้ว
