R 包教程：安装、加载与管理 R 包

packageDescription("stats")
help(package = "stats")技术支持

install.packages("vioplot")技术支持

Installing package into '/home/username/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.6'
(as 'lib' is unspecified)
trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/vioplot_0.4.0.tar.gz'
...
* DONE (vioplot)技术支持

install.packages(c("vioplot", "MASS"))技术支持

install.packages("vioplot", repos = "https://lib.ugent.be/CRAN")技术支持

install.packages("BiocManager")技术支持

BiocManager::install(c("GenomicFeatures", "AnnotationDbi"))技术支持

通过 devtools 安装包

如上所述，每个仓库都有各自的安装方式，如果您经常从不同来源安装包，这种差异可能会让人不便。更高效的方法可能是使用 devtools 简化流程，因为它针对各仓库（包括 CRAN）都提供了专用函数。

您可以像往常一样使用 install.packages("devtools") 安装 devtools，但可能还需要在 Windows 上安装 Rtools、在 Mac 上安装 Xcode 命令行工具，或在 Linux 上安装 r-base-dev 与 r-devel。

安装好 devtools 后，您就可以使用其中的工具函数安装其他包。选项包括：

• 从 Bioconductor 安装的 install_bioc()，

• 从 Bitbucket 安装的 install_bitbucket()，

• 从 CRAN 安装的 install_cran()，

• 从 git 仓库安装的 install_git()，

• 从 GitHub 安装的 install_github()，

• 从本地文件安装的 install_local()，

• 从 SVN 仓库 安装的 install_svn()，

• 从 URL 安装的 install_url()，以及

• 从 CRAN 包的特定版本安装的 install_version()。

例如，要从其 GitHub 仓库安装 babynames 包，您可以使用：

devtools::install_github("hadley/babynames")技术支持

如何更新、移除并检查已安装的 R 包

随着您使用 R 的时间增加，您可能每周甚至每天都会多次使用 install.packages()。考虑到 R 包开发的速度，不久之后您很可能需要更新或替换常用包。本节将介绍一些有助于管理包集合的函数。

• 检查您的计算机上安装了哪些包：

installed.packages()技术支持

• 使用 remove.packages() 可直接卸载包，例如：

remove.packages("vioplot")技术支持

• 检查哪些包需要更新：

old.packages()技术支持

• 更新所有包：

update.packages()技术支持

• 通过重新安装来更新特定包：

install.packages("vioplot")技术支持

使用 renv 管理包

对于项目级依赖管理，renv 包（由 Posit 维护）可创建隔离且可复现的包环境——类似于 Python 的虚拟环境。

install.packages("renv")

# Initialize renv in your project
renv::init()

# Take a snapshot of current packages
renv::snapshot()

# Restore packages from the lockfile
renv::restore()技术支持

renv 将精确的包版本记录在 renv.lock 文件中，因此协作者可以用 renv::restore() 复现您的环境。这对团队协作和长期项目尤为有用。

通过图形界面安装 R 包

如果您更喜欢图形界面，RStudio 和 RGui 都提供了包管理工具。在 RStudio（现由 Posit 开发）中，前往 Tools → Install Packages，并在对话框中输入包名。要全面了解 RStudio，请参阅我们的 RStudio 教程。

在 RGui 中，您可以在 Packages 菜单下找到相关工具。

如何加载包

安装包后，您即可使用其功能。如果您只是偶尔需要调用包内的少量函数或数据，可以使用 packagename::functionname() 的形式访问。例如，既然已安装 babynames 包，您可以探索其中的某个数据集。

要查看包中包含哪些函数与数据，使用 help(package = "babynames")。

要访问 babynames 包中的 births 数据集，只需输入：

babynames::births技术支持

## # A tibble: 6 x 2
##    year  births
##   <int>   <int>
## 1  2009 4130665
## 2  2010 3999386
## 3  2011 3953590
## 4  2012 3952841
## 5  2013 3932181
## 6  2014 3988076技术支持

如果您会更频繁地使用该包，那么将其加载到内存可能更方便。最简单的方法是使用 library() 命令。

请注意，install.packages() 的输入是字符向量，需要用引号包裹包名；而 library() 可以接受字符或名称，因此可不加引号书写包名。

加载后，您无需再使用 package::function() 的形式，可以像调用基础 R 的函数或数据一样直接访问其功能：

births技术支持

## # A tibble: 6 x 2
##    year  births
##   <int>   <int>
## 1  2009 4130665
## 2  2010 3999386
## 3  2011 3953590
## 4  2012 3952841
## 5  2013 3932181
## 6  2014 3988076技术支持

您可能听说过 require() 函数：它也可以加载包，但如果包未安装，它不会抛出错误。

因此请谨慎使用该函数！

您可以在谢益辉的博文中阅读更多 library() 与 require() 的比较。若想学习 R 基础（包括包管理），请参阅我们的 R 学习指南。

package 与 library 有何区别？

谈到 library() 函数时，人们有时会把 package 和 library 混为一谈，甚至把包称为“库”。

请不要混淆：library() 是用于加载包的命令，同时也指包所在的位置，通常是您计算机上的某个文件夹；而 package 则是便于分发的函数集合。

来自 Hadley Wickham（Posit（原 RStudio）首席科学家、DataCamp 课程 Writing Functions in R 授课讲师）的一段话很贴切：

@ijlyttle a package is like a book, a library is like a library; you use library() to check a package out of the library #rsats

— Hadley Wickham (@hadleywickham) December 8, 2014

另一个区分方式是直接不带参数运行 library()。它会列出您计算机上不同 library（文件夹）中已安装的包：

library()技术支持

如何一次性加载多个 R 包

与 install.packages() 不同，library() 每次只能加载一个包。常见的变通做法是使用 lapply()：

packages <- c("dplyr", "ggplot2", "tidyr")
lapply(packages, library, character.only = TRUE)技术支持

您也可以使用 pacman 包，它能一步完成缺失包的安装与加载，使用 p_load()。

如何卸载 R 包

要卸载指定包，您可以使用 detach() 函数。用法如下：

detach("package:babynames", unload = TRUE)技术支持

其他文档与求助渠道

如前文所述，DESCRIPTION 文件包含关于包的基本信息，但这些信息不足以指导您将其用于分析。此时您需要另外两类文档：帮助文件与小插曲（vignettes）。

help(vioplot, package = "vioplot")技术支持

library(babynames)
ls("package:babynames")技术支持

## [1] "applicants" "babynames"  "births"     "lifetables"技术支持

vignette(package = "ggplot2")技术支持

vignette("ggplot2-specs")技术支持