RNA-Seq với Bioconductor trong R

RNA-Seq là một phương pháp giải trình tự thế hệ mới đầy hứng thú, dùng để xác định các gen và con đường sinh học liên quan đến những bệnh lý hoặc tình trạng cụ thể. Khi giải trình tự throughput cao ngày càng rẻ hơn và tiếp cận được với nhiều nhà nghiên cứu hơn, kỹ năng phân tích loại dữ liệu này ngày càng trở nên giá trị. Hãy cùng học quy trình RNA-Seq và khám phá cách xác định những gen và quá trình sinh học có thể quan trọng cho tình trạng bạn quan tâm! Khóa học sẽ bắt đầu với phần tổng quan ngắn về quy trình RNA-Seq, nhấn mạnh vào phân tích biểu hiện sai khác (DE). Bắt đầu từ số đếm cho mỗi gen, khóa học sẽ hướng dẫn cách chuẩn bị dữ liệu cho phân tích DE, đánh giá chất lượng dữ liệu đếm, xác định điểm ngoại lai và phát hiện các nguồn biến thiên chính trong dữ liệu. Gói R DESeq2 sẽ được dùng để mô hình hóa dữ liệu đếm bằng mô hình nhị thức âm và kiểm định các gen có biểu hiện sai khác. Kết quả sẽ được trực quan hóa bằng heatmap và biểu đồ núi lửa, và các gen có biểu hiện sai khác có ý nghĩa sẽ được xác định và lưu lại.