RNA-Seq dengan Bioconductor di R

Pada bab ini, kita melakukan pengendalian mutu pada data hitungan RNA-Seq menggunakan heatmap dan principal component analysis. Kita mengeksplorasi kemiripan antar sampel dan menentukan apakah ada sampel yang merupakan pencilan.

Pada bab ini, kita menjalankan analisis differential expression, menghasilkan hasil, dan mengidentifikasi gen yang diekspresikan secara berbeda.

Pada bab terakhir ini kita mengeksplorasi hasil differential expression menggunakan visualisasi, seperti heatmap dan volcano plot. Kita juga meninjau langkah-langkah analisis dan merangkum alur kerja differential expression dengan DESeq2.