Build your ultimate AI agent
Deskripsi Kursus
Analisis ChIP-seq merupakan cabang penting bioinformatika. Analisis ini memberikan jendela untuk memahami mesin biologis yang membuat sel-sel dalam tubuh kita berfungsi. Baik itu sel otak yang membantu Anda membaca halaman web ini maupun sel imun yang berpatroli mencari mikroorganisme penyebab penyakit, semuanya membawa genom yang sama. Yang membedakan adalah gen mana yang aktif pada waktu tertentu. Gen-gen ini ditentukan oleh sistem kompleks protein yang dapat mengaktifkan dan menonaktifkan gen. Ketika mesin regulasi ini lepas kendali, hal itu dapat memicu kanker dan penyakit melemahkan lainnya. Analisis ChIP-seq memungkinkan kita memahami fungsi protein pengatur, bagaimana kontribusinya terhadap penyakit, serta memberi wawasan tentang cara kita dapat melakukan intervensi untuk mencegah sel keluar dari kendali. Dalam kursus ini, Anda akan mengeksplorasi himpunan data nyata sambil mempelajari cara memproses dan menganalisis data ChIP-seq di R.
Prasyarat
Kurikulum
Garis besar kursus
1
Pengantar ChIP-seq
Pengantar eksperimen ChIP-seq. Mengapa eksperimen ini menarik? Fenomena apa saja yang dapat dipelajari dengan ChIP-seq dan apa yang dapat kita pelajari dari eksperimen ini.
2
Kembali ke Dasar - Menyiapkan data ChIP-seq
Kini analisis ChIP-seq benar-benar dimulai. Bab ini memperkenalkan alat Bioconductor untuk mengimpor dan membersihkan data.
3
Membandingkan sampel ChIP-seq
Bab ini memperkenalkan teknik untuk mengidentifikasi dan memvisualisasikan perbedaan antar sampel ChIP-seq.
4
Dari Puncak ke Gen hingga Fungsi
Mampu mengidentifikasi pengikatan diferensial antar kelompok sampel itu bagus, tetapi apa artinya? Bab ini membahas strategi untuk menafsirkan hasil pengikatan diferensial, dari pemanggilan puncak hingga wawasan biologis yang bermakna.
R
ChIP-seq dengan Bioconductor di R
Kursus
Selesai
