Build your ultimate AI agent
Mô tả khóa học
Phân tích ChIP-seq là một nhánh quan trọng của tin sinh học. Nó mở ra cánh cửa nhìn vào bộ máy giúp các tế bào trong cơ thể chúng ta vận hành. Dù là tế bào não giúp bạn đọc trang web này hay tế bào miễn dịch tuần tra cơ thể để tìm vi sinh vật gây bệnh, tất cả đều mang cùng một bộ gen. Điều phân biệt chúng là những gen đang hoạt động tại một thời điểm nhất định. Những gen nào được bật là do một hệ thống protein phức tạp có thể kích hoạt hoặc bất hoạt gen quyết định. Khi bộ máy điều hòa này mất kiểm soát, nó có thể dẫn đến ung thư và các bệnh suy nhược khác. Phân tích ChIP-seq cho phép chúng ta hiểu chức năng của các protein điều hòa, cách chúng có thể góp phần gây bệnh và cung cấp manh mối về cách can thiệp để ngăn tế bào vượt khỏi tầm kiểm soát. Trong khóa học này, bạn sẽ khám phá một bộ dữ liệu thực tế trong khi học cách xử lý và phân tích dữ liệu ChIP-seq trong R.
Yêu cầu tiên quyết
Chương trình học
Đề cương khóa học
1
Giới thiệu về ChIP-seq
Giới thiệu về thí nghiệm ChIP-seq. Vì sao chúng thú vị? Những hiện tượng nào có thể nghiên cứu bằng ChIP-seq và chúng ta có thể học được gì từ các thí nghiệm này.
2
Quay về căn bản - Chuẩn bị dữ liệu ChIP-seq
Giờ thì phân tích ChIP-seq thực sự bắt đầu. Chương này giới thiệu các công cụ Bioconductor để nhập và làm sạch dữ liệu.
3
So sánh các mẫu ChIP-seq
Chương này giới thiệu các kỹ thuật để xác định và trực quan hóa khác biệt giữa các mẫu ChIP-seq.
4
Từ Peak đến Gen đến Chức năng
Khả năng xác định liên kết khác biệt giữa các nhóm mẫu là rất tốt, nhưng điều đó có ý nghĩa gì? Chương này thảo luận các chiến lược diễn giải kết quả liên kết khác biệt để đi từ gọi peak đến các hiểu biết có ý nghĩa sinh học.
R
ChIP-seq với Bioconductor trong R
Hoàn
thành khóa học
