700+ courses, half price
Kurs Açıklaması
ChIP-seq analizi, biyoinformatiğin önemli bir dalıdır. Vücudumuzdaki hücreleri çalıştıran düzeneklere bir pencere açar. İster bu web sayfasını okumana yardım eden bir beyin hücresi olsun, ister seni hasta edebilecek mikroorganizmalar için devriye gezen bir bağışıklık hücresi, hepsi aynı genomu taşır. Onları birbirinden ayıran, herhangi bir anda aktif olan genlerdir. Hangi genlerin aktif olacağı, genleri etkinleştirebilen ve devre dışı bırakabilen karmaşık bir protein sistemi tarafından belirlenir. Bu düzenleyici mekanizma kontrolden çıktığında, kansere ve diğer yıpratıcı hastalıklara yol açabilir. ChIP-seq analizi, düzenleyici proteinlerin işlevini, hastalığa nasıl katkıda bulunabileceklerini anlamamızı sağlar ve hücrelerin kontrolden çıkmasını önlemek için nasıl müdahale edebileceğimize dair içgörüler sunabilir. Bu kursta, R içinde ChIP-seq verilerini işlemeyi ve analiz etmeyi öğrenirken gerçek bir veri kümesini keşfedeceksin.
Ön Koşullar
Müfredat
Kurs planı
1
ChIP-seq’e Giriş
ChIP-seq deneylerine giriş. Neden ilgi çekiciler? ChIP-seq ile hangi olgular incelenebilir ve bu deneylerden neler öğrenebiliriz.
2
Temellere Dönüş - ChIP-seq verisini hazırlama
Artık ChIP-seq analizi gerçekten başlıyor. Bu bölüm, veriyi içe aktarmak ve temizlemek için Bioconductor araçlarını tanıtıyor.
3
ChIP-seq örneklerini karşılaştırma
Bu bölüm, ChIP-seq örnekleri arasındaki farkları belirleme ve görselleştirme tekniklerini tanıtıyor.
4
Tepe Noktalarından Genlere ve İşleve
Örnek grupları arasında farklı bağlanmayı belirleyebilmek harika, peki bu ne anlama geliyor? Bu bölüm, tepe çağrılarından biyolojik açıdan anlamlı içgörülere ulaşmak için farklı bağlanma sonuçlarını yorumlama stratejilerini tartışıyor.
R
R ile Bioconductor kullanarak ChIP-seq
Kurs
Tamamlandı
