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कोर्स

R में limma के साथ Differential Expression Analysis

उन्नत4 घंटे

डिफरेंशियल जीन एक्सप्रेशन विश्लेषण के लिए Bioconductor पैकेज limma का उपयोग करना सीखें।

R4 घंटे15 वीडियो47 अभ्यास3,900 XP8,162उपलब्धि प्रमाणपत्र

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कोर्स विवरण

माइक्रोएरे, सीक्वेंसिंग, और मास स्पेक्ट्रोमेट्री जैसी फंक्शनल जीनोमिक तकनीकें वैज्ञानिकों को जीन एक्सप्रेशन स्तरों के निष्पक्ष माप पूरे जीनोम स्तर पर इकट्ठा करने में सक्षम बनाती हैं। चाहे आप अपना डेटा जनरेट कर रहे हों या सार्वजनिक रूप से उपलब्ध बड़ी संख्या में डेटासेट्स को एक्सप्लोर करना चाहते हों, सबसे पहले आपको ऐसे प्रयोगों का विश्लेषण करना सीखना होगा। इस कोर्स में, आप सीखेंगे कि सबसे आम प्रायोगिक डिज़ाइनों पर Differential Expression Analysis करने के लिए बहुमुखी R/Bioconductor पैकेज limma का उपयोग कैसे करें। इसके अलावा, आप यह भी सीखेंगे कि डेटा को प्री-प्रोसेस कैसे करें, बैच इफेक्ट्स की पहचान और सुधार कैसे करें, परिणामों का विज़ुअल आकलन कैसे करें, और एनरिचमेंट टेस्टिंग कैसे करें। कोर्स पूरा करने के बाद, आपके पास किसी भी फंक्शनल जीनोमिक्स स्टडी से इनसाइट पाने के लिए सामान्य विश्लेषण रणनीतियाँ होंगी।

पूर्वापेक्षाएँ

पाठ्यक्रम

कोर्स रूपरेखा

2

सामान्य स्टडी डिज़ाइनों के लिए लचीले मॉडल

इस अध्याय में, आप सामान्य प्रायोगिक डिज़ाइनों के लिए Differential Expression को जाँचने हेतु लीनियर मॉडल बनाना सीखेंगे।
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3

प्री- और पोस्ट-प्रोसेसिंग

4

केस स्टडी: Doxorubicin उपचार का प्रभाव

इस अंतिम अध्याय में, आप अपनी नई स्किल्स का उपयोग करके एक एंड-टू-एंड Differential Expression Analysis करेंगे, जिसमें फ़ैक्टोरियल डिज़ाइन का उपयोग कर अलग-अलग जेनेटिक बैकग्राउंड वाले चूहों के दिलों पर कैंसर दवा doxorubicin के प्रभाव का आकलन किया गया है।
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