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课程

在 R 中使用 limma 进行差异表达分析

高级4 小时

学习使用 Bioconductor 包 limma 进行差异基因表达分析。

R4 小时15 个视频47 个练习3,900 XP8,209成就证明

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课程简介

功能基因组学技术(如微阵列、测序和质谱)使科研人员能够在全基因组尺度上无偏测量基因表达水平。无论您是自己生成数据,还是想探索大量公开数据集,都需要先学会如何分析这类实验。在本课程中,您将学习如何使用功能强大的 R/Bioconductor 包 limma,在最常见的实验设计上进行差异表达分析。此外,您还将学习如何对数据进行预处理、识别并校正批次效应、可视化评估结果,以及执行富集检验。完成本课程后,您将掌握适用于任意功能基因组学研究的一般分析策略,以获取有意义的见解。

先修要求

课程体系

课程大纲

3

前处理与后处理

4

案例研究:阿霉素处理的影响

在最后一章中,您将运用新学到的技能,对一项采用析因设计的研究进行端到端的差异表达分析,以评估抗癌药物阿霉素对不同遗传背景小鼠心脏的影响。
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R

在 R 中使用 limma 进行差异表达分析

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